1. Выделение ДНК, амплификация и секвенирование фрагментов генов (до 1000 п.н.)
2. Все виды филогенетического и филогеографического анализа по фрагментам генов
3. Выявление криптического разнообразия, методы делимитационного анализа.
4. Популяционная генетика
5. Пробоподготовка библиотек для секвенирования нового поколения на платформах Illumina, PacBio
Лаборатория оснащена секвенатором по Сэнгеру, амплификаторами, микроцентрифугами, плашечной центрифугой. Также есть все оборудование, необходимое для работы с НК: термостат, вортексы, вакуумный отсасыватель, ротатор, Qubit 2.0 и Nanodrop для измерения концентрации НК, форезные камеры, наборы дозаторов, в т.ч. многоканальных, система гель-документации.
По всем вопросам, пожеланиям и предложениям можно обращаться к ответственному за лабораторию Екимовой Ирине Александровне (Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.+79161676869, к. 481)
ПРАВИЛА РАБОТЫ В МОЛЕКУЛЯРНОЙ ЛАБОРАТОРИИ КАФЕДРЫ ЗООЛОГИИ БЕСПОЗВОНОЧНЫХ (к. 481)
Все пользователи лаборатории обязаны пройти инструктаж перед началом работы.- Пользователи, планирующие работу в лаборатории, обязаны внести депозит из предполагаемого расчета количества образцов и выполняемых работ (в виде наличных средств на расходники или закупки необходимых для работы расходников по согласованию с ответственными).
А) Данные о количестве образцов по каждому этапу (выделение, ПЦР, секвенирование) необходимо внести в таблицуhttps://docs.google.com/spreadsheets/d/1hCN5QV5JhP2iBFX-TJu0e7vkCD7wDEpHIjUaPcvDfMA/edit?usp=sharing.
Расчет депозита делается на основе таблицы:https://disk.yandex.ru/i/iQ9PYwb_g8j3jQ.
Б) В лаборатории имеется небольшой запас средств для работы студентов, руководители которых не имеют грантов. Тогда в таблице вместо суммы депозита укажите слово «студент». Пожалуйста, не планируйте в таком случае большой объем работы, предварительно таким образом могут быть получены до 20 образцов по 2 генам на 1 человека (т.е. сумма до 10000 по таблице).
- Секвенирование (постановка сиквенсовой реакции, очистка, денатурация, загрузка прибора, обработка полученных фрагментов, рассылка с результатами секвенирования) проводится исключительно сотрудниками лаборатории (Екимова И.А., Становова М.В.). Секвенирование занимает от 2 до 7 рабочих дней в зависимости от загрузки лаборатории.
- Если у вас есть свои пожелания по реактивам (определенные наборы по выделению ДНК, синтез специфических праймеров, специальные наборы для высокоточного ПЦР), в лаборатории есть возможность приобрести их заранее. Тем не менее, их покупка может занять время (от 3 дней до месяца), что необходимо учитывать при планировании работы.
- При наличии собственных расходников и/или оборудования (и желания ими воспользоваться), пользователь должен поставить в известность ответственного.
- Если Вам необходимо пройти обучение молекулярным методам, сделать это можно по договоренности с ответственным. Обучение сотрудников проводится по вторникам и средам, с 14:00 до 20:00. Возможны исключения, но это решается в частном порядке.
- Обучение (и последующая работа) студентов в лаборатории осуществляется либо научным руководителем (ТОЛЬКО при наличии соответствующей квалификации), либо сотрудником лаборатории, в таком случае сотрудник лаборатории включается в соруководители ВКР студента и/или соавтором в статью, в зависимости от объема задачи. Возможны другие варианты компенсации трудозатрат сотрудника, они решаются в частном порядке.
- Для работы в лаборатории пользователи должны сообщить ответственным о планируемой работе (не менее чем за 1 рабочий день). В лаборатории возможна одновременная работа не более 3 пользователей.
- Пользователи лаборатории после каждой работы (выделение ДНК, ПЦР, секвенирование) должны записаться в журнал работы, с указанием ФИО, даты и количества образцов.
- После работы в «грязной зоне» с ампликонами, работа в «чистой зоне» с нуклеиновыми кислотами в тот же день запрещена.
- Пользователи обязаны убирать за собой рабочее место. Сюда входит: прожигание ламинаров УФ, мытье использованной посуды, протирание поверхностей спиртом. Пользователи должны также записаться в расписание уборки лаборатории (влажная уборка поверхностей - каждые две недели. Ссылка на расписание: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1IXM9bXSs2z1Ga05YZf9h5-eLQvQGjKn52-S3pTXp1yc/edit?usp=sharing).
- Вход в уличной обуви или с едой в лабораторию запрещен. Также желательно одевать одежду без ворса или лабораторный халат.
- Работа в летнее время возможна по согласованию с ответственным.
- При несоблюдении данных правил пользователи в лабораторию допускаться не будут.
По всем вопросам, пожеланиям и предложениям можно обращаться к ответственным за лабораторию Екимовой Ирине Александровне (Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.+79161676869, к. 481) и Станововой Марии Владиславовне (Адрес электронной почты защищен от спам-ботов. Для просмотра адреса в вашем браузере должен быть включен Javascript.,+79099057268к. 481)
